20 марта 2020 года Департаменту сохранения биоразнообразия и особо охраняемых природных территорий, исполнилась юбилейная дата «80» лет со дня его образования.

В 1940 году постановлением Совета Народных Комиссаров Киргизской АССР от 20 марта за № 358 при Совете Народных Комиссаров Киргизской АССР, была образована Государственная инспекция по охотничьему хозяйству. И постановлением Советов Народных Комиссаров Киргизской АССР от 20 апреля 1942 года No 424, было утверждено Положение об охотничьем хозяйстве Киргизской ССР.

В 1958 году преобразована в Инспекцию по охотничьему хозяйству и заповедникам, и тот же год положил начало созданию особо охраняемых природных территорий в республике. Созданы Иссык-Кульский, Нарынский, Джети-Огузский, Токмакский, Теплоключенский и Джети-Огузский государственные охотничьи заповедники. В последующие годы создан Сары-Челекский заповедник, укрепляется материально-техническая база Иссык-Кульского заповедника.

На протяжении многих лет в Кыргызстане менялись и уточнялись названия органов управления объектами биоразнообразия, но всегда главными задачами оставались сбережение, восстановление объектов биоразнообразия и рациональное его использование.

Вся история становления и развития лесного, охотничьего хозяйств и сети особо охраняемых природных территорий республики, подходила неразрывной связи друг с другом.

Решением Правительства Кыргызской Республики от 16 января 2019 года № 11, создан Департамент сохранения биоразнообразия и особо охраняемых природных территорий Государственного агентства охраны окружающей среды и лесного хозяйства при Правительстве Кыргызской Республики.